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溶菌酶化學性質非常穩定，當pH值在一定范圍內劇烈變化時，其結構幾乎不變。溶菌酶不可逆變性的臨界點是77℃，隨溶劑的變化，不可逆變性臨界點也發生變化，當溶菌酶所處溶液pH值小于1時，不可逆變性臨界點降低到43℃

1． 溶菌酶是一種無毒、的蛋白質，又具有一定的溶菌作用，因此可用作天然的食品防腐劑。現已廣泛應用于水產品、肉食品、蛋糕、清酒、料酒及飲料中的防腐；還可以添入乳粉中，使牛乳人乳化，以抑制中腐敗微生物的生存，同時直接或間接地促進中雙歧桿菌的增殖。

2． 溶菌酶作為一種存在于人體正常體液及組織中的因素，具有多種，它具有、、的，溶菌酶其適應癥為、、血痰和等。

3． 溶菌酶具有破壞細菌細胞壁結構的功能，以此酶處理G+細菌得到 原生質體，因此，溶菌酶是基因工程、細胞工程中 細胞融合操作必不可少的工具酶。